TEKNIK Restriction Fragment Length Polimorphism (RFLP) PADA IKAN NAPOLEON (Cheilinus undulatus)

Abstract

Ikan napoleon (Cheilinus undulatus) merupakan jenis ikan laut yang mempunyai nilai ekonomis tinggi. Tujuan dari percobaan ini untuk mengetahui tata cara analisis DNA menggunakan enzim pemotong sehingga dapat menunjukkan polimorfisme genetik pada ikan napoleon. Restriction Fragment Length Polimorfism (RFLP) merupakan salah satu metode analisis DNA dengan menggunakan primer target tertentu dan selanjutnya dipotong menggunakan enzim pemotong untuk menghasilkan polimorfisme DNA. Sebanyak 20 sampel, ikan napoleon yang digunakan untuk analisis berasal dari Labuhan Bajo (Nusa Tenggara Timur). Dari hasil analisis terlihat bahwa primer 16 SrDNA mampu mengamplifikasi fragmen DNA ikan napoleon dengan bobot molekul 700 bp. Penggunaan empat enzim pemotong yaitu Hae III, Hinf I, Hha I, dan Mbo I dapat memotong pita DNA secara sempurna. Pemotongan menggunakan enzim pemotong Hha I mampu memperlihatkan polimorfisme.