EVALUASI MARKA PERTUMBUHAN MIKROSATELIT CCA08 PADA IKAN MAS RAJADANU TAHAN INFEKSI KHV DAN TUMBUH CEPAT

Abstract

Pemanfaatan marka molekuler mikrosatelit dapat mempercepat kegiatan pemuliaan dalam memperbaiki karakter genetik pada ikan. Saat ini telah dilaporkan lokus mikrosatelit Cca08 berasosiasi dengan karakter tumbuh cepat pada ikan mas. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi lokus Cca08 pada populasi ikan mas Rajadanu tahan infeksi KHV dan tumbuh cepat. Populasi ikan mas Rajadanu tahan infeksi KHV dan tumbuh cepat merupakan hasil kegiatan pemuliaan dan koleksi Balai Penelitian Pemuliaan Ikan. Evaluasi lokus Cca08 dilakukan pada lima populasi ikan mas Rajadanu yaitu populasi P, F0, F1, F2, dan F3. Lokus Cca08 diamplifikasi menggunakan primer spesifik mikrosatelit Cca08, hasil amplifikasi diseparasi dengan alat analisa fragmen (Qiaxcell, Qiagen). Data alel mikrosatelit diolah mengunakan program Microsoft excel dan dianalisis menggunakan program Fstat dan Arlequin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lokus Cca08 dapat teramplifikasi dan polimorfik pada populasi ikan mas Rajadanu tahan infeksi KHV dan tumbuh cepat. Sebanyak empat alel terindentifikasi pada populasi ikan mas yang diuji yaitu alel 140, 172, 180, dan 192, dengan genotipe yang teramati sebanyak tujuh kombinasi genotipe. Frekuensi alel 180 dan genotipe 180/ 180 meningkat pada populasi ikan mas Rajadanu hasil seleksi. Lokus Cca08 dengan genotipe 180/180 dapat dijadikan marka tumbuh cepat pada ikan mas khususnya strain Rajadanu.