ANALISIS RASIO RNA/DNA IKAN PATIN SIAM Pangasianodon hypophthalmus F-2 TUMBUH CEPAT HASIL SELEKSI

Abstract

Seleksi ikan patin siam (Pangasianodon hypophthalmus) tumbuh cepat telah dilakukan sebagai upaya perakitan strain unggul ikan siam. Ikan patin siam hasil seleksi menunjukkan performa pertumbuhan yang lebih baik dibandingkan kontrolnya (non-seleksi). Salah satu metode yang telah banyak digunakan untuk menggambarkan rata-rata pertumbuhan adalah rasio RNA/DNA.Ikan yang lebih kecil diduga memiliki rasio RNA/DNA yang lebih rendah dibandingkan ikan yang lebih besar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui rasio RNA/DNA pada ikan patin siam F-2 tumbuh cepat hasil seleksi dan kontrol serta hubungan antara rasio RNA/DNA dengan pertumbuhan. Sampel ikan yang digunakan adalah ikan patin siam tumbuh cepat hasil seleksi dan kontrol masing-masing sebanyak 15 ekor dengan rata-rata panjang standar 45,3 ± 1,8 cm; panjang total 54,6 ± 2,0 cm dan bobot 2214,60 ± 237,20 g untuk ikan patin siam hasil seleksi, sedangkan untuk ikan patin siam kontrol rata-rata panjang standar 33,5 ± 3,0 cm; panjang total 42,3 ± 3,5 cm dan bobot 690,40 ± 194,53 g. Metode ekstraksi genom DNA dilakukan dengan menggunakan kit GeneJET (Thermo Scientific) sedangkan ekstraksi total RNA dilakukan dengan menggunakan tri reagent. Pengukuran konsentrasi DNA dan RNA dilakukan menggunakan GeneQuant.Uji t-test dengan menggunakan program SPSS versi 15.0 untuk mengetahui perbedaan rasio RNA/DNA antara ikan patin siam F-2 tumbuh cepat dengan kontrol pada taraf 0,05. Hasil penelitian menunjukkan bahwa nilai rasio RNA/DNA yang diperoleh pada ikan patin siam seleksi (23,75) lebih tinggi dibandingkan ikan patin siam kontrol (16,87). Hasil analisis uji T menunjukkan bahwa rasio RNA/DNA ikan patin siam seleksi berbeda nyata (P<0,05) dengan rasio RNA/ DNA ikan patin siam kontrol. Analisis regresi menunjukkan bahwa rasio RNA/DNA ikan patin siam mempunyai korelasi yang erat dengan panjang standar (R = 0,883), panjang total (R = 0,894), dan bobot (R = 0,896) ikan patin siam.