KARAKTERISTIK GENETIK DAN FILOGENETIK SPESIES IKAN LAYANG (Decapterus sp) YANG TERTANGKAP DI PERAIRAN BITUNG

Rudi Saranga, Heru Santoso, Jul Manohas, Nurdin Kasim, Ismail ismail, Deni Sarianto, Gretyo Eduard Dara Lie, Givensius Gomair

Abstract


Sumberdaya kelompok ikan Layang di perairan Bitung memiliki nilai ekonomis sehingga perlu dilakukan pengelolaan berdasarkan nama spesies ikan yang valid. Salah satu ciri khusus perikanan tangkap di Indonesia adalah multispesies dan multigear dan dalam pencatatan ikan hasil tangkapan hanya menggunakan nama kelompok ikan, sehingga untuk satu nama kelompok ikan dapat terdiri dari beberapa spesies ikan. Penelitian ini bertujuan melakukan identifikasi spesies ikan layang yang tertangkap di perairan Bitung secara genetik untuk mendapatkan spesies yang valid. Untuk mendapatkan karakteristik genetik dan filogenetik dari 4 sampel ikan layang dilakukan ekstraksi DNA, Polymerase Chain Reaction (PCR), penyuntingan DNA dan analisis filogenetik dan evolusi molekuler menggunakan program MEGA versi X. Hasil penelitian mendapatkan bahwa secara genetik ikan layang anggur Bitung merupakan spesies Decapterus smithvanizi dan ikan layang biru dengan ukuran kecil, sedang dan besar merupakan spesies Decapterus macarellus. Filogenetik D. smithvanizi Bitung memiliki jarak kekerabatan yang dekat dengan jenis yang sama dari perairan Philipina, sedangkan D. macarellus Bitung memiliki kekerabatan yang dekat dengan jenis yang sama dari perairan Vietnam. Perlu dilakukan kajian aspek biologi D. smithvanizi untuk melengkapi informasi yang belum tersedia saat ini.


Keywords


Filogenetik, Genetik, Ikan Layang, Perairan Bitung

Full Text:

PDF

References


Badan Pusat Statstik Provinsi Sulawesi Utara, 2023. Provinsi Sulawesi Utara Dalam Angka 2023. 821 hal.

Emmanuel S. Delloro Jr, Ricardo P. Babaran, Arnold C. Gaje, Pearlyn T. Cambronero, Ulysses B. Alama, Hiroyuki Motomura. (2021). First record of slender red scad,

Decapterus smithvanizi (Actinopterygii: Perciformes: Carangidae), from the Philippines. Acta Ichthyologica et Piscatoria. 51(3), 233–239. DOI 10.3897/aiep.51.63117

Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R. (1994). DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol. 3(5), 294-299.

Forum Ilmiah dan Konsultatif Pengelolaan Perikanan Berkelanjutan (FIKP2B) Provinsi Sulawesi Utara. (2022). Laporan Teknik Kondisi Stok Ikan Pelagis Kecil di Perairan Laut Sulawesi Utara, Provinsi Sulawesi Utara (WPPNRI 716). 43 hal.

Hata H & Motomura H. (2017). First record of Decapterus smithvanizi (Perciformes: Carangidae) from Uchinoura Bay, Kagoshima Prefecture, Southern Japan. Nature of Kagoshima 43: 123–126. [In Japanese] http://journal.kagoshima-nature.org/archives/NK_043/043-024.pdf.

Iwatsubo H, Kimura S, Motomura H (2016) First Japanese records of the slender red scad, Decapterus smithvanizi (Perciformes: Carangi- dae), from Kagoshima and the East China Sea. Nature of Kagoshi- ma 42: 179–182. [In Japanese] http://journal.kagoshima-nature.org/ archives/NK_042/042-023.pdf.

Jaafar T.N.A.M, M.I. Taylor, S.A.M. Nor, M. de Bruy & G.R. Carvalho. (2012). DNA Barcoding Reveals Cryptic Diversity within Commercially Exploited Indo- Malay Carangidae (Teleosteii: Perciformes). PLoS ONE 7(11), e49623.

Kempter J., M. Kielpinski, R. Paniczi, K. Mikolajczyk & S. Keszka. (2015). Genetic Traceability of Selected Populations of the Yellowstripe Scad, Selaroides leptolepis (Actinopterygii: Perciformes: Carangidae), Based on the Analysis of Microsatellite DNA—Celfish roject—Part 3. Acta Ichthyologica Et Piscatoria. 45(3), 299–305.

Kimura S, Katahira K & Kuriiwa K. (2013). The red-fin Decapterus group (Perciformes: Carangidae) with the description of a new species, Decapterus smithvanizi. Ichthyological Research 60(4): 363–379. https://doi.org/10.1007/s10228-013-0364-9.

Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C & Tamura K. (2018). MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution. 35,1547-1549.

M. Kaimudin, Sumarsana, M.S.Y. Radiena, S.H. Noto. (2021). Karakteristik Pangan Fungsional Nuget dan Stik dari Tepung Ikan Layang Ekor Merah (Decapterus Kuroides) dan Ampas Tahu. JPHPI 2021. 24(3), 370-380.

Palumbi, S. R. (2003). Population genetics, demografic connectivity, dang the design of marine reserves. Ecological Applications. 13(1), 146–158.

Psomadakis P.N, Osmany H.B, Moazzam M. (2015). Field identification guide to the living marine resources of Pakistan. FAO species identification guide for fishery purposes. Food and Agriculture Organization of the United Nations, Rome, [i–x +] 386 pp. [+ pls. 1–42].

Psomadakis P.N, Thein H, Russell B.C, Tun M.T. (2020) Field identification guide to the living marine resources of Myanmar. FAO species identification guide for fishery purposes. Food and Agriculture Organization of the United Nations, and Department of Fisheries, Ministry of Agriculture, Livestock and Irrigation, Republic of the Union of Myanmar, Rome, [i–xvii +] 694 pp. [+ pls. 1–58].

Saranga R, Hetty M.P.O, Gede D.R.W, Daduk S, Yuli E.H. (2017). Morfo-Species Charesteristics and Phylogenetic of Trevally Species (Family Carangidae) Caught Within Mallucas Sea of Indonesia. Journal of Engineering and Applied Sciences. 12(8), 8446-8453.

Smith-Vaniz W.F, Carpenter K.E, Jiddawi N, Borsa P, Obota C, Yahya S. (2018). Decapterus smithvanizi. The IUCN Red List of Threat- ened Species 2018: e.T123424845A123494632. https://doi.org/10.2305/IUCN.UK.2018-2.RLTS. T123424845A123494632.en

Stecher G, Tamura K, and Kumar S (2020) Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) for macOS. Molecular Biology and Evolution(https://doi.org/10.1093/molbev/msz312).

Tamura K. and Nei M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution. 10, 512-526.

Wiadnya D.G.R, D. Setyohadi, Widodo & Soemarno (2015). Intra- species variations of Photopectoralis bindus (Family: Leiognathidae) collected from two geographical areas in East Java, Indonesia. JBES 6(1),160-168

Yan Li. (2001). How to Build a Phylogenetic Tree dalam http://guava.physics.uiuc.edu/~nigel/courses/598BIO/498BIOonline-essays/hw2/files/hw2_li.pdf

http://www.itis.gov. Diakses 5 Januari 2024.

http://www.fishbase.org. Diakses 7 Januari 2024.

http://www.ncbi.nlm.nig.gov. Diakses 22 November 2024.




DOI: http://dx.doi.org/10.15578/bawal.17.1.2025.46%20-%2055

Creative Commons License
Bawal Widya Riset Perikanan Tangkap is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
View My Stats
p-ISSN 1907-8226
e-ISSN 2502-6410